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解讀PYCR家族對ccRCC和泛癌細(xì)胞功能、預(yù)后價值、免疫浸潤的影響

更新時間:2024-09-22  |  點擊率:464

20247月,《International Journal of Molecular Sciences》上發(fā)表論文:“Deciphering the Effects of the PYCR Family on Cell Function, Prognostic Value, Immune Infiltration in ccRCC and Pan-Cancer"

“解讀PYCR家族對ccRCC和泛癌細(xì)胞功能、預(yù)后價值、免疫浸潤的影響"

 

摘要:

吡咯-5-羧酸還原酶(PYCR)是將吡咯-5-羧酸酯(P5C)轉(zhuǎn)化為脯氨酸的關(guān)鍵,這是脯氨酸合成的最后一步。PYCR1、PYCR2PYCR3三種異構(gòu)體存在,并在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展中發(fā)揮著重要的調(diào)節(jié)作用。

在這項研究中,科研人員先通過泛癌癥分析評估了PYCRs的分子和免疫特征,特別是關(guān)注它們與預(yù)后的相關(guān)性。然后,建立腎透明細(xì)胞癌(KIRC)特異性預(yù)后模型,結(jié)合病理特征來增強(qiáng)預(yù)測能力。通過體外實驗研究PYCR1PYCR2在腎癌細(xì)胞中的生物學(xué)功能和調(diào)控機(jī)制。PYCRs在多種腫瘤中的表達(dá)均升高,與不良臨床結(jié)果相關(guān)。PYCRs在腫瘤信號通路中富集,與免疫細(xì)胞浸潤、腫瘤突變負(fù)荷(TMB)和微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)顯著相關(guān)。在KIRC中,基于PYCR1PYCR2的預(yù)后模型在統(tǒng)計學(xué)上得到了獨立驗證。利用HE染色圖像的特征,病理特征模型可靠地預(yù)測患者預(yù)后。體外實驗表明,PYCR1PYCR2通過激活mTOR通路,至少部分地增強(qiáng)了腎癌細(xì)胞的增殖和遷移。這項研究強(qiáng)調(diào)了PYCRs在各種腫瘤中的關(guān)鍵作用,將其定位為潛在的預(yù)后生物標(biāo)志物和治療靶點,特別是在惡性腫瘤如KIRC中。這些發(fā)現(xiàn)強(qiáng)調(diào)需要更廣泛地探索PYCRs在泛癌癥背景下的意義。

 

在該研究中,對人腎細(xì)胞癌細(xì)胞系,即Caki-1、786-OA498細(xì)胞的體外培養(yǎng),經(jīng)慢病毒轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,均用到了Ausbian進(jìn)口胎牛血清。


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